韓國“世越”號沉船打撈作業結束，冒著“史無前例難度和風險”執行這一任務的中國上海打撈局卻承受著巨大損失。韓國《朝鮮日報》12日稱，中國上海打撈局局長洪沖在接受該報采訪時透露，“雖然很難說具體數額有多大，但我們花費了比當初預想的費用多幾倍的錢。我們還從銀行貸款1億美元。”據韓聯社13日報道，上海打撈局要求韓國政府追加支付1000億韓元(約合人民幣6.1億元)的打撈費用，但韓國政府不愿支付那么多，目前雙方正在就具體金額進行協商。

韓聯社援引韓國海洋水產部方面的消息說，上海打撈局與韓國政府簽署合同時的打撈費用為916億韓元，但上海打撈局主張實際打撈費用為2800億韓元。

據報道，韓國政府與上海打撈局簽署打撈合同時，原計劃于2016年6月底完成作業，但水中作業情況復雜程度超出預期，消除殘留燃油和船尾設置起重橫梁花費大量時間。上海打撈局發現船尾受卡的情況，原打算改用爆破或挖泥等方式打撈，但韓國海洋水產部堅持按原定的“海底犁地”法進行，導致作業時間大大增加。

《朝鮮日報》稱，據工程師出身的洪沖介紹，“世越”號比他們最初收到的數據重很多，重心位置和當初推測出現很大偏差。而且，開始作業時，他們聽說海底層是淤泥和石子等，但實際挖開來看，卻是堅硬的巖石層。打穿巖石的作業難度很高，比預計多花了四五個月。

《朝鮮日報》援引政府高層人士的消息說，海洋水產部決定彌補上海打撈局的部分損失，追加支付規模預計在300億至400億韓元，上限不超過500億韓元。據韓國《每日經濟》13日報道，韓方的基本立場是，可以支付的是為期兩個月的海底搜索作業費以及打撈過程中產生的其他實際費用等，但各種不可抗力產生的打撈費用應該排除在外。韓國海洋水產相關人士13日稱，雙方正在進行協商，相信很快可以得出結論。